肠道特征怎么挖？肠菌采样注意啥？

“暗物质”（宿主感染、核糖核酸和从未总括过的 DNA 比较简单版）进行时生物学分析，这也为消化子系统菌种的生态精研特质提供了更是为恰当的生物学分析。

而随着长三读长三核酸上新技术的普及，较长三比较简单版的拼装鉴定提供了更是准确的定义结果。因此，操作定义单元（operational taxonomic units，OTU）或扩增子脱氧核糖核酸变异棒状（amplicon sequence variants，ASV）的使用率将迅速下降。

此外，鸟枪律宏遗传三组精研还可以帮助我们探究上新病菌和菌类的激素与机能遗传，以对生态精研特质总括大幅度不足之处。

出上新于对菌种里罕见透生物的标记必要性，鸟枪律所遭遇的原因主要是核酸厚度。就此而言，首先要警惕的点是，与扩增子核酸律相较，鸟枪律在较低的核酸厚度所能提供的关于消化子系统菌种里罕见透生物的电子邮件更是极多。而且，鸟枪律还实际上一个原因，那就是由于取样原理受限，有些试样所获得的脱氧核糖核酸大部分来源于棒状液，而非菌种，这一点在活检标本及管腔刷检标本里尤为引人注意。

尽管与环境试样相较，消化子系统菌种是现阶段深入研究总和的胸部，但具棒状在线始终不比较简单，电子邮件还是有所缺陷。因此，虽然很多电子邮件可以通过核酸等形式获得，但却未获得有效性利用。

③ 机能宏遗传三组精研 除了上新核酸上新技术的获取，资料生物学分析应用软件也可以帮助我们对消化子系统菌种机能创设起更是全盘的认知。Picrust2 等应用软件可以构建基于扩增子核酸获得的资料，断定出上新透自然环境里的激素与致病遗传。尽管这类应用软件未反之亦然获得机能特质电子邮件，但也有利于我们理解可能可能会发生在菌种肥胖过程里的激素巨大变化。

鸟枪律可以反之亦然获得透自然环境的机能特质电子邮件，如激素与毒力遗传。如果把透自然环境视作一个总棒状，那么了解到透自然环境的机能特质则比合三组更是不可忽视。此外，为了对核酸结果作大幅度不足之处，往往可以通过资料生物学分析生物学分析，总括特定机能，如制剂适应性遗传或静止遗传元件。

耐药动力精研是“ one health 假说”宣扬的不可忽视特质，也是制剂适应性遗传在人类、爬虫类和环境之数间转回的结论。对于静止遗传元件，为了重上新考虑到其质粒/质棒状/拆分子的结构，只能结合长三读长三核酸上新技术和短读长三核酸上新技术。核糖核酸虽然是病菌水平遗传转回的不可忽视参与者，然而有关核糖核酸在制剂适应性遗传转回里所发挥的作用，是否如同在毒力遗传传播里展现出上新得那样，至今即已揭晓。

④ 均可能会精研为首生物学分析 均可能会精研或拆分三组精研（遗传三组精研-转录三组精研-蛋白三组精研-激素三组精研）于是以成为资料生物学分析科技领域不可忽视且便于使用的应用软件，可以全盘总括与疟疾有关的菌种机能，以及随时数间推移个棒状内的巨大变化情况，这些巨大变化有别于因疟疾、制剂、饮食习惯巨大变化等造成了的任何肥胖。

由于每个三组精研都有自己的实验工序，而且有时只能从同一个棒状里浓缩多个试样，因此每个三组精研都是独立进行时的，不过所有结果可能会进行时为首生物学分析，以分析方律菌种生理互联网。此外，套用均可能会精研原理不仅能了解到透自然环境，还可以了解到其与宿主的的关系，这也是件很倒是的两件事。

这种原理所遭遇的再一主要是如何将由大量实验激发的不尽相同类型的资料拆分到一同。边际具棒状生物学分析、回归生物学分析、拉普拉斯或贝叶斯数精研模型等生物学原理主要使用解决那些由多个生物学精研独立观测所断定计算出来上新的遗传、转录、蛋白质和激素物之数间的关系。于是以如所有上新科技领域在探讨过程里可能会历经的那样，这些生物学原理在质疑声里不断改进前行，直到摸索创设出上新一套适合深入研究消化子系统菌种生理精研的原理。

原文链接：

O handbook on gut microbiome：a global perspective

作者｜Paúl Cárdenas, MD, PhD

编译｜77

审校｜617

主笔｜

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